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如何在酶解DNA时保护好你的RNA

作者:Michelle Tetreault Carlson 来源:美国MoBio实验室【字号:

核酸提取过程中DNA酶解步骤是引起RNA降解或丢失的最常见原因之一。酶解反应一般在硅胶离心柱上进行,这对离心柱式核酸提取来说是一种节省时间的好方法,但对富含DNA的样品而言就不那么有效率了(比如脾脏,胸腺,甚至某些土壤样品),这种情况下,需要在溶液中对DNA进行酶解。

经典的DNA酶解程序最后一步涉及加EDTA或者加热灭活酶,这两种方式都会影响RT-PCR结果:EDTA会抑制RT-PCR酶的活性,加热会导致RNA完整性受损。另外,大部分DNA酶需要冷冻保存并且多管分装以避免多次冻融降低酶活性。

我们推出了一套能全程保护RNA的酶解体系:DNase Max

DNase Max:是一种可在室温下稳定保存的高活性(1ul酶能在20分钟内消化30ugDNA)DNA酶溶液。最强大的部分是清除DNA酶这一步。DNA酶和阳离子被一种强特异性的树脂吸附而从RNA样品中清除,无需添加酶抑制剂或者加热,终产物可直接用于qRT-PCR。与竞争性试剂盒比较,该树脂非常高效,单次反应能完全去除10个单位DNA酶(如下图,3-4泳道),而竞争试剂盒仅能去除2单位DNA酶(如下图,1-2泳道)。

这意味着几个小时的工作过程中你都能很好的保护你的珍贵RNA,最终得到更准确的基因表达分析结果。

DNase Max去除树脂完全去除DNA酶

RNA样品分别由DNase Max™ 试剂盒和竞争对手的试剂盒进行DNA消化以及DNase去除。操作严格按照官方说明书进行。通过MO BIO 的DNase-free认证办法,对DNase残留活性进行分析。条带5为阴性对照,不使用DNase。所有样品37℃孵育1h,65℃ 5min灭活。1%琼脂凝胶电泳展示如图,DNase Max去除树脂成功地去除掉所有DNase(条带3-4),而竞争对手产品的树脂并不能完全去除样品中的所有DNase(条带1-2)。

保护RNA的其他产品

无论什么来源的样品,RNA的提取从来都是不容易的,尤其是样品有限或者不可替代的时候。因为RNA不稳定,所以操作小心快速很关键。有很多方法可以在操作中保护起到RNA的作用,使你操作起来更加轻松而不必焦虑。

用BME、均匀快速地研磨和使用带清除树脂并且经认证不含RNA酶的DNA酶将成为你成功提取任意样品RNA的小技巧。此外,要去除工作台和设备上的核酸酶,应用实验室清洁喷雾(12095)十分有效,经认证不含RNA酶的手套(1556)的使用也能提供极大的帮助,在我们的实验室,这些都是必不可少的。

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